G蛋白偶聯(lián)受體(GPCR)是35%獲批藥物的靶點,但已解析結構的受體數量很少,主要難點在于傳統(tǒng)去垢劑體系難以獲得穩(wěn)定、有功能的樣品。去垢劑會剝離保護性脂質,導致蛋白聚集、配體結合能力下降,往往需要數周反復優(yōu)化才能滿足實驗需求。
無細胞蛋白合成(CFPS)技術可有效解決這一問題,能避免細胞毒性并實現(xiàn)膜蛋白共翻譯整合。在體系中加入預組裝的脂質納米盤后,新合成的GPCR可直接插入近天然的脂雙層環(huán)境中。這種無需去垢劑、“合成即穩(wěn)定"的策略能夠保留關鍵的脂質-蛋白相互作用,并支持對可調控設計參數(支架尺寸、脂質組成)進行快速篩選優(yōu)化,大幅提升蛋白表達量與功能性折疊效率。

圖1.無細胞蛋白合成體系可在翻譯過程中實現(xiàn)GPCR向特定脂質環(huán)境的共翻譯插入。
eProteinDiscoveryGPCR納米盤篩選試劑盒通過優(yōu)化膜支架蛋白尺寸與脂質組分,結合自動化數字微流控快速平行篩選,可在短時間內確定GPCR理想的表達條件并獲得可直接用于實驗的活性蛋白。

圖2.eProteinDiscovery無細胞蛋白表達篩選系統(tǒng)工作流程。
本應用展示了一套快速制備高活性熱穩(wěn)定截短型火雞 β1腎上腺素能受體(ttsΔβ1AR)的實驗流程。借助eProteinDiscovery微流控無細胞蛋白表達技術,高通量篩選并確定了理想脂質組成方案,相較于通用脂質體系可使受體的功能性配體結合活性提升3倍。目標受體放大表達后,通過尺寸排阻色譜(SEC)精制將活性單體比例富集至約45%,從而實現(xiàn)了在72小時內獲得了可滿足結構解析要求的高純度ttsΔβ1AR。
人源全長β1腎上腺素能受體(hβ1AR)、人源全長熱穩(wěn)定型β1腎上腺素能受體(htsβ1AR)及熱穩(wěn)定截短型火雞 β1腎上腺素能受體(ttsΔβ1AR)的表達構建體均基于Kock等人與Rues等人的前期研究進行設計。分別在受體序列的N端與C端引入3C酶切位點與TEV酶切位點接頭序列,隨后通過eGeneFlexiVariant試劑盒將目標序列組裝為適配eProteinDiscovery系統(tǒng)的線性DNA模板。
采用eProteinDiscovery系統(tǒng)及微流控芯片,對3種β1AR變體與8組無細胞反應體系進行自動化多重篩選。每種體系包含無細胞表達試劑、PDI/GSSG氧化還原混合液,以及預組裝納米盤或緩沖液對照。共測試7種納米盤:其中4種來自GPCR納米盤篩選試劑盒,3種為通用型納米盤(表1)。其余表達與純化試劑均采用膜蛋白專用試劑盒配套試劑。

表1.用于eProteinDiscovery多重篩選的8組無細胞反應體系。
參照優(yōu)化方案進行放大表達:用于初步LAC分析時,構建含DNA構建體、無細胞表達試劑、PDI/GSSG以及MSP1E3D1納米盤等的反應體系,29℃過夜孵育,經鏈霉親和素磁珠純化后,對粗產物和洗脫液進行SDS-PAGE分析;用于制備型SEC時,構建3mL反應體系并分為1mL等分孵育,加入RNaseA處理后純化、合并洗脫液并濃縮,蛋白產量采用eProtein定量試劑盒測定。
將濃縮的ttsΔβ1AR放大樣品上樣至經SEC運行緩沖液預平衡的Superdex200 Increase 10/300凝膠過濾柱,收集各峰組分并濃縮至約50μL,速凍后于-80℃保存。
采用WatersACQUITYPremier系統(tǒng)對SEC組分進行分析型SE-UHPLC驗證。取10μL過濾樣品上樣至蛋白SEC色譜柱,柱溫25℃、樣品室4℃;以含磷酸氫二鈉、NaCl和精氨酸的緩沖液(pH7.5)為流動相,0.4mL/min流速運行8min,通過色氨酸熒光檢測蛋白洗脫。
取7.5μg純化的ttsΔβ1AR,與20μL預平衡的瓊脂糖樹脂于微型離心柱中4℃孵育2小時。
用洗滌緩沖液洗滌樹脂3次,加入含異丙腎上腺素的洗脫緩沖液室溫孵育2小時后離心洗脫活性受體。采用eProtein定量試劑盒測定蛋白濃度,并通過比較層析前后蛋白量計算結合率。
使用eProteinDiscovery無細胞蛋白表達篩選系統(tǒng),可在24小時內完成3種β1AR變體在8組無細胞混合體系中的表達與純化產量分析。該步驟可快速確定能有效表達蛋白的載體與條件組合,降低GPCR制備流程風險。如圖3所示,帶負電的納米盤(DOPG、DMPG)在所有β1AR變體中均獲得較大純化產量。其中ttsΔβ1AR變體純化濃度可達約5μM,因此被選用于放大制備與功能表征。

圖3.eProteinDiscovery篩選結果。
在6種篩選出的納米盤條件下對ttsΔβ1AR進行過夜放大表達,可成功獲得約100μg/mL的純化受體。與篩選結果一致,MSP1E3D1?DOPG和MSP1E3D1?DMPG納米盤組總蛋白產量高(圖4A)。SDS?PAGE結果證實ttsΔβ1AR在目標分子量處成功表達(圖4B)。

圖4.ttsΔβ1AR放大制備結果。(A)ttsΔβ1AR在6種不同MSP-脂質組分體系中的放大純化產量;(B)ttsΔβ1AR在3種體系中放大表達后的電泳圖。
eProteinDiscovery系統(tǒng)可準確預測蛋白產量并指導放大,但產量高并不代表受體有功能,而脂質組成對GPCR活性構象影響很大。研究通過配體親和層析(LAC)測定放大后樣品的結合率(圖5A)。結果表明,受體功能明顯依賴脂質類型,eProteinDiscoveryGPCR納米盤效果更優(yōu)。在DOPG、POPC/POPS、POPC/POPS/膽固醇體系中,ttsΔβ1AR的功能結合率是DMPG體系的3倍(圖5B),而POPC體系表達的ttsΔβ1AR無活性。

圖5.配體結合初步研究。(A)配體親和層析(LAC)示意圖;(B)ttsΔβ1AR在6種不同MSP-脂質組分中的結合率。
Nuclera的GPCR專用納米盤憑借合理的脂質設計,通過不飽和、帶合適電荷比例的脂質組分提供了適配GPCR的柔性天然膜環(huán)境,大幅提升了β1AR活性,遠優(yōu)于飽和脂質或純中性脂質體系。
選用活性與產量優(yōu)的DOPG體系表達的ttsΔβ1AR進行制備型SEC精制,分離去除聚集體與錯誤組裝蛋白,得到單體目標復合物;經檢測,峰3活性結合率達45%,較初始純化提升3倍,可用于后續(xù)結構和功能研究。

圖6.ttsΔβ1AR樣品質量富集。(A)MSP1E3D1-DOPG體系表達產物的SEC圖譜;(B)各SEC組分的分析型SE-UHPLC結果;(C)LAC結合分析顯示峰3活性組分提升3倍。
eProteinDiscovery系統(tǒng)工作流程將膜蛋白迭代優(yōu)化周期從數月縮短至數天。采用快速自動化無細胞蛋白表達篩選,替代了耗時的細胞宿主構建和去垢劑篩選,可在72小時內獲得活性GPCR蛋白。
該系統(tǒng)能高通量篩選DNA構建體與納米盤組合,快速確定高產優(yōu)質條件,相比普通脂質配方,其功能配體結合活性提升3倍。這種自動化篩選與近天然納米盤體系,為結構生物學和藥物靶點發(fā)現(xiàn)提供了穩(wěn)定的高質量受體樣品制備方案。
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