溶解性:溶于水,溶于乙醇、DMSO等部分有機(jī)溶劑
注意事項(xiàng):現(xiàn)配現(xiàn)用,不可頻繁解凍
【分子構(gòu)成與結(jié)構(gòu)特點(diǎn)】
吖啶橙是一種陽離子熒光染料,其分子核心由三環(huán)芳香平面結(jié)構(gòu)(吖啶環(huán))構(gòu)成,側(cè)鏈連接兩個(gè)N,N-二甲基氨基基團(tuán)。該平面結(jié)構(gòu)賦予分子強(qiáng)烈的π-π堆積能力,使其能夠通過嵌入方式插入雙鏈核酸的堿基對之間。吖啶橙的鹽酸鹽與氯化鋅復(fù)合物形式提高了其水溶性及儲存穩(wěn)定性。
熒光特性方面,吖啶橙在不同結(jié)合狀態(tài)下呈現(xiàn)顯著不同的發(fā)射光譜:當(dāng)嵌入雙鏈DNA時(shí),其最大發(fā)射波長約為525 nm(綠色熒光);當(dāng)與單鏈核酸或RNA結(jié)合時(shí),由于聚集態(tài)的形成核酸選擇性熒光染料 吖啶橙,發(fā)射波長紅移至約650 nm(紅色熒光)?;谶@一光譜差異,吖啶橙可實(shí)現(xiàn)對DNA與RNA的選擇性區(qū)分。
1. 細(xì)胞周期與凋亡分析:在流式細(xì)胞術(shù)中,吖啶橙被廣泛用于區(qū)分細(xì)胞周期的不同階段(G0/G1、S、G2/M),其染色后DNA熒光強(qiáng)度與細(xì)胞DNA含量呈線性相關(guān)。實(shí)驗(yàn)典型濃度范圍為5–20 μg/mL,染色時(shí)間15–30分鐘,需在避光條件下操作以保證信號穩(wěn)定性。
2. 核酸選擇性染色與成像:在熒光顯微鏡下,吖啶橙可同時(shí)標(biāo)記細(xì)胞核(DNA,綠色)與核仁及胞漿RNA(紅色),實(shí)現(xiàn)亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)可視化。對于固定樣本,推薦使用PBS稀釋至1–5 μg/mL進(jìn)行染色;活細(xì)胞染色則需更低濃度(0.5–2 μg/mL)并縮短孵育時(shí)間。
3. 核酸凝膠電泳顯色:作為替代溴化乙錠的熒光染料,吖啶橙可用于瓊脂糖凝膠中DNA的快速檢測。染色方法分為后染與預(yù)染兩種,后染濃度通常為3–5 μg/mL,浸泡時(shí)間20–40分鐘,使用UV或藍(lán)光激發(fā)即可成像。
配制儲存液時(shí),建議以去離子水或PBS緩沖液(pH 7.2–7.4)配制1 mg/mL母液,分裝后避光冷凍保存。母液在-20℃條件下可穩(wěn)定保存6個(gè)月,但反復(fù)凍融會導(dǎo)致熒光強(qiáng)度下降,建議單次分裝量滿足一次實(shí)驗(yàn)用量。
實(shí)際染色操作中,需根據(jù)樣本類型優(yōu)化染料濃度與染色時(shí)間。對于細(xì)胞懸液,推薦在染色完成后立即上機(jī)檢測,避免長時(shí)間放置導(dǎo)致非特異性結(jié)合增加。對于組織切片,建議在染色后進(jìn)行兩次PBS漂洗(每次5分鐘)以降低背景熒光。
溴化乙錠(EB,CAS:1239-45-8):經(jīng)典核酸嵌入型染料,但具有強(qiáng)致突變性,需謹(jǐn)慎操作
SYBR Green I(CAS:163795-75-3):高靈敏度DNA染料,適用于實(shí)時(shí)定量PCR與凝膠成像
DAPI(CAS:28718-90-3):細(xì)胞核特異性染料,優(yōu)先結(jié)合富含AT的DNA區(qū)域,適用于固定細(xì)胞核定位
Hoechst 33258(CAS:23491-44-3):活細(xì)胞膜通透性核酸染料,常用于活細(xì)胞DNA含量分析
碘化丙啶(PI,CAS:25535-16-4):膜不透過性染料,專門用于死細(xì)胞核染色與細(xì)胞周期檢測
注:該試劑僅用于科學(xué)研究,不能用于人體實(shí)驗(yàn)或其他治療型用途。
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