伯樂(lè)(Bio-Rad)Mini-PROTEAN Tetra系列(含型號(hào)1658003,通常指電極芯或配套組件)電泳出現(xiàn)條帶模糊、拖尾(泳道內(nèi)彌散,分辨率下降,條帶邊緣不清晰),常見原因與解決方案如下。染色前就能判斷的擴(kuò)散問(wèn)題,請(qǐng)按順序排查最可能的環(huán)節(jié)。
一、樣品問(wèn)題(約占40%)
1、蛋白降解
(1)現(xiàn)象:所有條帶下方出現(xiàn)模糊彌散,類似“彗星尾",或高分子量條帶缺失。
(2)解決辦法:
樣品新鮮制備,全程冰上操作。
加入蛋白酶抑制劑(如PMSF、cocktail)。
避免反復(fù)凍融(分裝保存,-20℃或-80℃)。
2、上樣量過(guò)大或過(guò)濃
(1)現(xiàn)象:條帶過(guò)寬,呈“扇"形擴(kuò)散,甚至相鄰泳道相互干擾。
(2)解決辦法:
減少上樣量(可嘗試減半)。一般來(lái)說(shuō),考馬斯亮藍(lán)染色每孔上樣20-50 μg總蛋白足夠,銀染需更少。
若樣品太黏稠,可適當(dāng)稀釋(用1×上樣緩沖液)。
3、高鹽或去垢劑干擾
(1)現(xiàn)象:樣品孔下方出現(xiàn)橫向彌散,或條帶扭曲。
(2)解決辦法:
樣品鹽濃度應(yīng)< 100 mM(尤其是NaCl、KCl)。高鹽可通過(guò)透析或稀釋解決。
SDS終濃度不宜超過(guò)2%,上樣緩沖液中的SDS已足夠。
二、凝膠配制問(wèn)題(約占30%)
1、分離膠與濃縮膠界面不平或聚合不均
(1)現(xiàn)象:條帶呈波浪形模糊,且在同一泳道內(nèi)上下寬度不一。
(2)解決辦法:
灌注分離膠后立即用飽和正丁醇或去離子水封壓,確保液面絕對(duì)水平。
待分離膠聚合(室溫>30 min,或37℃ 20 min)后,倒掉封液,用濾紙吸干殘余液體。
灌注濃縮膠后立即插入梳子,避免氣泡殘留于齒間。
2、凝膠過(guò)期或儲(chǔ)存不當(dāng)
(1)現(xiàn)象:整個(gè)膠板通透性下降,條帶嚴(yán)重拖尾,甚至跑不動(dòng)。
(2)解決辦法:
使用新鮮配制的30%丙烯酰胺/甲叉雙丙烯酰胺(Acr/Bis),避光4℃保存不超過(guò)1個(gè)月。
TEMED和APS要分裝凍存,避免失效。APS現(xiàn)配現(xiàn)用(10%溶液一周內(nèi)有效)。
3、pH不準(zhǔn)確
(1)現(xiàn)象:條帶整體偏斜且模糊,分離效果差。
(2)解決辦法:
確認(rèn)分離膠緩沖液(1.5 M Tris-HCl,pH 8.8)和濃縮膠緩沖液(0.5 M Tris-HCl,pH 6.8)的pH準(zhǔn)確,需用pH計(jì)校準(zhǔn)。
不要用Tris堿直接替代緩沖液。
三、電泳條件與緩沖液?jiǎn)栴}(約占20%)
1、電泳緩沖液(running buffer)失效或濃度錯(cuò)誤
(1)現(xiàn)象:條帶明顯變寬、泳道內(nèi)彌散,且溴酚藍(lán)遷移不整齊。
(2)解決辦法:
使用新鮮配制的1× Tris-甘氨酸-SDS緩沖液(25 mM Tris, 192 mM甘氨酸, 0.1% SDS,pH 8.3)。
不要反復(fù)回收使用超過(guò)2次,尤其SDS會(huì)沉淀失效。
2、電壓過(guò)高導(dǎo)致焦耳熱
(1)現(xiàn)象:凝膠發(fā)熱(手摸外殼燙),條帶呈現(xiàn)“弓"形模糊,邊緣擴(kuò)散。
(2)解決辦法:
采用恒流或低電壓:濃縮膠80 V,分離膠120 V即可。
將電泳槽置于冰浴或4℃冷室中進(jìn)行;或用磁力攪拌器攪拌外槽緩沖液以散熱。
3、內(nèi)槽漏液(電極芯密封不嚴(yán))
(1)現(xiàn)象:內(nèi)槽液面下降,電流不穩(wěn),條帶一側(cè)拖尾嚴(yán)重且泳道間差異大。
(2)解決辦法:
檢查電極芯底部綠色密封墊有無(wú)異物、破損或老化(貨號(hào)1658038,可更換)。
正確安裝電極芯:傾斜放入后,確保密封墊壓緊玻璃板;灌滿內(nèi)槽液后靜置1分鐘,檢查是否漏液。
四、硬件與操作細(xì)節(jié)(約占10%)
1、電極絲斷裂或污染
(1)現(xiàn)象:條帶極淺、模糊甚至無(wú)信號(hào),且只在某一側(cè)泳道明顯。
(2)解決辦法:
目檢電極芯上鉑金絲是否完整,有無(wú)黑色沉積(可用稀鹽酸浸泡清洗)。
用萬(wàn)用表測(cè)電阻,兩電極間應(yīng)導(dǎo)通。
2、梳子未清洗干凈或梳齒變形
(1)現(xiàn)象:加樣孔處條帶起始端模糊,呈現(xiàn)“毛邊"狀拖尾。
(2)解決辦法:
每次制膠后立即用去離子水洗凈梳子,避免殘留凝膠。
梳齒若有彎曲,需更換(貨號(hào)1658036或1658039)。
3、拔梳子過(guò)快或膠未凝固
(1)現(xiàn)象:加樣孔底部不平整,上樣后蛋白在孔內(nèi)擴(kuò)散。
(2)解決辦法:
濃縮膠聚合至少30分鐘(室溫)。用潤(rùn)洗針頭吹打孔內(nèi)殘余未聚合膠液。
拔梳子時(shí)要垂直、緩慢、勻速,避免左右晃動(dòng)。
五、快速診斷流程
1、所有條帶均模糊拖尾
排查:樣品降解、緩沖液失效、電壓過(guò)高
驗(yàn)證:換新鮮緩沖液,降低電壓,跑已知好樣品
2、個(gè)別泳道拖尾
排查:加樣孔損壞、孔內(nèi)有殘膠
驗(yàn)證:用藍(lán)槍頭吹打加樣孔;換梳子重制膠
3、條帶呈波浪形模糊
排查:膠界面不平、內(nèi)槽漏液
驗(yàn)證:重制膠,并在灌內(nèi)槽液后檢漏
4、高分子量區(qū)拖尾嚴(yán)重
排查:蛋白降解或凝膠pH錯(cuò)誤
驗(yàn)證:加蛋白酶抑制劑,校準(zhǔn)緩沖液pH
5、電泳中電流劇烈波動(dòng)
排查:內(nèi)槽漏液
驗(yàn)證:拆開電極芯檢查密封圈
六、總結(jié)
先跑一板新膠,用新鮮緩沖液和已知完好的蛋白Marker(如預(yù)染Marker,10 kDa至250 kDa)。若Marker也出現(xiàn)模糊拖尾,則問(wèn)題出在凝膠或電泳系統(tǒng)(重配膠、換密封墊);若Marker正常,則問(wèn)題在樣品(降解或雜質(zhì))。