在新藥研發(fā)的戰(zhàn)場(chǎng)上,科學(xué)家們面臨一道經(jīng)典難題:想看清藥物對(duì)細(xì)胞究竟做了什么,需要高分辨率成像;想篩遍成千上萬(wàn)個(gè)化合物,又要求極快的速度。兩者如同魚與熊掌。高端高內(nèi)涵分析系統(tǒng)(HCA)的出現(xiàn),正是為了解開這道結(jié)。以橫河電機(jī)的CellVoyager系列為例,CQ1、CQ3000到CV8000,它們身上凝聚了這類儀器的幾個(gè)關(guān)鍵特征。
看得清,還要看得“柔”
高端高內(nèi)涵的第一個(gè)門檻,是成像質(zhì)量。普通熒光顯微鏡拍厚樣本時(shí),畫面常像蒙了一層霧——焦平面以外的雜散光干擾嚴(yán)重。CellVoyager系列的核心技術(shù),是微透鏡增強(qiáng)的Nipkow轉(zhuǎn)盤共聚焦掃描單元(CSU)。一個(gè)旋轉(zhuǎn)盤上密布兩萬(wàn)個(gè)針孔,另一個(gè)盤上是對(duì)應(yīng)的微透鏡。激發(fā)光穿過(guò)微透鏡,精準(zhǔn)聚焦在每個(gè)針孔,像無(wú)數(shù)支極細(xì)的激光筆同時(shí)掃描樣本。多光束并行掃描帶來(lái)兩個(gè)好處:一是快,每秒能捕捉上千幀圖像;二是光毒性和光漂白大幅降低——每個(gè)點(diǎn)受到的照射時(shí)間極短,細(xì)胞在長(zhǎng)時(shí)間觀察下依然活蹦亂跳。CV8000甚至配備了可更換的針孔盤(25μm和50μm),厚的樣本用小孔提升共聚焦效果,暗的樣本換大孔捕獲更多信號(hào)。
從2D到3D,從單層到類器官
藥物研發(fā)的趨勢(shì),正從培養(yǎng)皿里扁平的細(xì)胞層,轉(zhuǎn)向更接近人體的三維模型——球體、類器官、甚至器官芯片。這對(duì)成像系統(tǒng)提出新要求:激光必須穿透更深的組織,同時(shí)保持清晰。CQ1可以對(duì)3D培養(yǎng)容器內(nèi)的球體直接成像、量化分析,無(wú)需像流式細(xì)胞術(shù)那樣把細(xì)胞從培養(yǎng)皿里取出來(lái)?yè)v碎。CQ3000配備的高數(shù)值孔徑水浸物鏡,擅長(zhǎng)捕捉液體中細(xì)胞的精細(xì)結(jié)構(gòu),20倍水浸物鏡的分辨率遠(yuǎn)超同倍率的干鏡頭,拍出的球體圖像層次分明。CV8000更進(jìn)一步,通過(guò)水浸物鏡和自動(dòng)供水系統(tǒng),讓高分辨率3D成像成為篩選流程中的常規(guī)操作。
活細(xì)胞“紀(jì)錄片”,一拍好幾天
許多藥物效應(yīng)不是瞬間發(fā)生的——細(xì)胞如何遷移、分化、對(duì)藥物做出延遲反應(yīng),需要幾小時(shí)甚至幾天的連續(xù)觀察。這就要求儀器本身就是一個(gè)穩(wěn)定的小型培養(yǎng)箱。三款系統(tǒng)都內(nèi)置了高精度物載培養(yǎng)箱,精準(zhǔn)控制溫度、濕度和二氧化碳濃度。HeLa細(xì)胞在CV8000里培養(yǎng)72小時(shí),增殖曲線與常規(guī)培養(yǎng)箱幾乎重合,只有四個(gè)角孔略有差異。這種穩(wěn)定性讓延時(shí)攝影變得可靠:CQ3000能以每秒100幀的速度捕捉心肌細(xì)胞的搏動(dòng)、鈣信號(hào)的波動(dòng),把轉(zhuǎn)瞬即逝的動(dòng)態(tài)變成可分析的數(shù)據(jù)。
自動(dòng)化:不知疲倦的實(shí)驗(yàn)助手
高通量篩選需要處理幾十、上百塊孔板,人工操作既慢又容易出錯(cuò)。高端高內(nèi)涵系統(tǒng)正在接管這些重復(fù)勞動(dòng)。CQ3000具備“目標(biāo)搜索”功能:先用低倍鏡掃描整個(gè)孔,根據(jù)預(yù)設(shè)條件(如熒光強(qiáng)度、形態(tài)特征)鎖定目標(biāo)位置,再切換高倍鏡精細(xì)成像。整個(gè)過(guò)程自動(dòng)完成,既減少了數(shù)據(jù)量,又避免了漏掉稀有細(xì)胞。CV8000更進(jìn)一步,集成了機(jī)器人移液器——它可以在成像中途自動(dòng)吸取試劑、添加到指定孔中,甚至調(diào)節(jié)添加速度,捕捉藥物刺激瞬間的細(xì)胞反應(yīng)。配合培養(yǎng)皿處理機(jī)器人,整套系統(tǒng)可以24小時(shí)無(wú)人值守運(yùn)行。
軟件:從看見到看懂
采集圖像只是第一步,從海量照片里提取有意義的生物學(xué)信息,才是真正的挑戰(zhàn)。CellVoyager系列配套的CellPathfinder分析軟件,正在變得越來(lái)越“聰明”。它的界面直觀,預(yù)設(shè)了多種實(shí)驗(yàn)?zāi)0?,點(diǎn)選菜單就能運(yùn)行分析。計(jì)算結(jié)果以圖表呈現(xiàn),雙擊任意數(shù)據(jù)點(diǎn),立刻跳轉(zhuǎn)到對(duì)應(yīng)的原始圖像——結(jié)果可追溯、可驗(yàn)證。
更關(guān)鍵的是引入了機(jī)器學(xué)習(xí)和深度學(xué)習(xí)模塊。研究人員可以手動(dòng)圈出幾張典型細(xì)胞圖像,告訴軟件“這就是我要的”;軟件學(xué)會(huì)特征后,自動(dòng)從數(shù)萬(wàn)張圖片里挑出同類對(duì)象。對(duì)于明場(chǎng)圖像這類缺乏染色的樣本,CE明場(chǎng)功能通過(guò)計(jì)算生成類似熒光染色的效果,讓無(wú)標(biāo)記分析成為可能。CV8000還新增了深度學(xué)習(xí)選項(xiàng),進(jìn)一步提升復(fù)雜表型的識(shí)別準(zhǔn)確率,讓AI輔助的無(wú)偏評(píng)估真正落地。
開放與集成
一臺(tái)孤立的高級(jí)儀器,價(jià)值終究有限。CQ1和CQ3000支持外部系統(tǒng)集成,可以通過(guò)API與搬運(yùn)機(jī)器人、第三方數(shù)據(jù)分析軟件對(duì)接。數(shù)據(jù)格式采用通用的FCS、CSV、OME-TIFF,方便導(dǎo)入Omero等平臺(tái)進(jìn)行深度挖掘。這意味著,高內(nèi)涵系統(tǒng)可以嵌入實(shí)驗(yàn)室現(xiàn)有的自動(dòng)化鏈條和信息流程,而不是制造一個(gè)新的數(shù)據(jù)孤島。
從CQ1的緊湊全能,到CQ3000的靈活組合,再到CV8000的集成化篩選平臺(tái),橫河電機(jī)的CellVoyager系列勾勒出高端高內(nèi)涵系統(tǒng)的進(jìn)化路徑:成像更清晰、對(duì)細(xì)胞更溫柔、看得更深更久、操作更自動(dòng)、分析更智能。這些特征匯聚到一起,目標(biāo)只有一個(gè)——讓研究人員從繁瑣的重復(fù)勞動(dòng)中解放出來(lái),把精力留給真正需要思考的科學(xué)問(wèn)題。
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