小鼠全腦細胞識別和計數(shù)
- 公司名稱 合肥百會拓知科技有限公司
- 品牌 bitelligen
- 型號
- 產(chǎn)地
- 廠商性質(zhì) 生產(chǎn)廠家
- 更新時間 2026/5/14 9:58:47
- 訪問次數(shù) 238
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客戶只需把小鼠腦寄來,我們會進行一系列透明化處理,并在我們的成像設備上進行掃描成像,得到所有腦片的最大值投影圖,再通過我們的高性能計算集群,以及自研的算法和軟件,實現(xiàn)對圖像大數(shù)據(jù)的存儲、管理和多種分析,包括三維重構(gòu)、圖譜配準和神經(jīng)元形態(tài)重建等。客戶只需等待十天左右既能夠得到滿意的結(jié)果。在整個試驗過程中客戶都能在我們的網(wǎng)站上看到實驗的實施進展。
PuClear透明化技術特點:
1. 共價固定結(jié)構(gòu): PuClear透明化技術采用共價鍵固定結(jié)構(gòu)的方式,將腦片內(nèi)的蛋白質(zhì)、核酸等結(jié)構(gòu)與水凝膠框架結(jié)合在一起。
2. 原位結(jié)構(gòu)保留: PuClear技術在透明化處理過程中,腦片內(nèi)的結(jié)構(gòu)保持在原位,不會發(fā)生移動或失真。
3. 光學性能改善: PuClear透明化處理后,光線通過組織時不會發(fā)生偏折,可以實現(xiàn)清晰、均勻的三維成像。相比之下,傳統(tǒng)的透明化處理方法可能會導致光線的散射或折射,影響成像質(zhì)量。
4. 成像范圍擴大: PuClear技術可以處理較厚的組織樣本(如腦片),使得成像范圍擴大到了300μm厚度范圍內(nèi)。傳統(tǒng)的透明化處理方法可能對較厚的組織樣本效果不佳,成像范圍受到限制。
多維同步飛掃熒光顯微成像(VISoR)技術是一項新型快速三維微米分辨成像技術。它結(jié)合了腦組織透明化、同步掃描成像和三維重構(gòu)技術,能夠以很高的分辨率在短時間內(nèi)完成小鼠全腦突觸級別的解析。該技術的主要特點包括:
1. 同步掃描實現(xiàn)連續(xù)清晰成像: 通過同步掃描,實現(xiàn)了在樣品運動中連續(xù)清晰成像,大大提高了成像速度,達到了數(shù)百倍于傳統(tǒng)成像技術的速度。
2. 快速成像速度: 在1.5小時內(nèi)即可完成對小鼠全腦的成像,每個體素的分辨率為0.5×0.5×2.5 μm3,生成的原始數(shù)據(jù)圖像約為16TB。
3. 多通道成像: 適用于不同大小的樣品,可以進行多通道成像,包括小鼠腦等組織樣品,具有廣泛的應用前景。
4. 兼容各種標記方法,可擴展至超大樣品: 該技術兼容各種標記方法,可用于不同類型的樣品,甚至可以擴展至超大樣品的成像。
我們通過搭建的高性能計算集群,以及自主開發(fā)的算法和軟件,實現(xiàn)了對PB級圖像大數(shù)據(jù)的存儲、管理和多種分析,包括圖像拼接、三維重構(gòu)、圖譜配準和神經(jīng)元形態(tài)重建等。
而PB級圖像大數(shù)據(jù)分析(Petabyte-scale image data analysis)具有以下特點:
1. 處理規(guī)模龐大: PB級圖像大數(shù)據(jù)意味著數(shù)據(jù)量非常龐大,需要處理的圖像數(shù)量可達到百萬級甚至更多。這種大規(guī)模數(shù)據(jù)需要使用高效的計算和存儲系統(tǒng)來進行處理和管理。
2. 高維度數(shù)據(jù): 圖像數(shù)據(jù)通常是高維度的,每個像素可能包含多個維度的信息,因此,對于PB級圖像大數(shù)據(jù)的分析需要考慮到數(shù)據(jù)的多維特性。
3. 計算密集型: 對PB級圖像大數(shù)據(jù)進行分析通常需要進行大量的計算,例如圖像處理、特征提取、模式識別等。這些計算通常是密集型的,并且需要使用高性能的計算資源來進行處理。
4. 存儲需求高: PB級圖像大數(shù)據(jù)需要大規(guī)模的存儲系統(tǒng)來進行管理和存儲。這些存儲系統(tǒng)需要具有高容量、高可靠性和高吞吐量的特點,以滿足數(shù)據(jù)存儲和訪問的需求。



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